Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdca4Q9CWM2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdca4Q9CWM2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdca4Q9CWM2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdca4Q9CWM2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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