Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NubplQ9CWD8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms