Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc5Q9CRA8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms