Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5sQ9CRA7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms