Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ykt6Q9CQW1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ykt6Q9CQW1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms