Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms