Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf2Q9CQJ4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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