Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms