Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc5Q9CQA1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc5Q9CQA1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc5Q9CQA1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc5Q9CQA1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms