Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpa3Q9CQ71 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpa3Q9CQ71 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms