Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mid1ip1Q9CQ20 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mid1ip1Q9CQ20 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms