Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce3Q9CPR8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nsmce3Q9CPR8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms