Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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