Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim26Q99PN3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim26Q99PN3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254.8 ms