Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms