Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NsmfQ99NF2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NsmfQ99NF2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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