Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms