Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brms1Q99N20 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms