Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp26Q99MX1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp26Q99MX1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms