Protein–RNA interactions for Protein: Q99MK9

Rassf1, Ras association domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf1Q99MK9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf1Q99MK9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms