Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp1b1Q99LU0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms