Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cstf3Q99LI7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cstf3Q99LI7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms