Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf34Q99KR6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf34Q99KR6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf34Q99KR6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf34Q99KR6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf34Q99KR6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rnf34Q99KR6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rnf34Q99KR6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rnf34Q99KR6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf34Q99KR6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms