Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf19Q99KP6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms