Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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TrabdQ99JY4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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TrabdQ99JY4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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TrabdQ99JY4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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TrabdQ99JY4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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TrabdQ99JY4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrabdQ99JY4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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TrabdQ99JY4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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TrabdQ99JY4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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TrabdQ99JY4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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TrabdQ99JY4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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TrabdQ99JY4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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