Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip2Q99JG7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip2Q99JG7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms