Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ddb2Q99J79 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ddb2Q99J79 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ddb2Q99J79 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ddb2Q99J79 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ddb2Q99J79 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ddb2Q99J79 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddb2Q99J79 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddb2Q99J79 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddb2Q99J79 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddb2Q99J79 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddb2Q99J79 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ddb2Q99J79 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ddb2Q99J79 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddb2Q99J79 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddb2Q99J79 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms