Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clip1Q922J3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clip1Q922J3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms