Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms