Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Pde6cQ91ZQ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Pde6cQ91ZQ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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Pde6cQ91ZQ1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Pde6cQ91ZQ1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Pde6cQ91ZQ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Pde6cQ91ZQ1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pde6cQ91ZQ1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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