Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna2Q91X60 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms