Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd3Q91W18 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd3Q91W18 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms