Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc3Q8VEM9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhdc3Q8VEM9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms