Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PpcsQ8VDG5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpcsQ8VDG5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms