Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam20bQ8VCS3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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