Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxapQ8VCG9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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