Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5J9

Arl6ip5, PRA1 family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip5Q8R5J9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl6ip5Q8R5J9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip5Q8R5J9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip5Q8R5J9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip5Q8R5J9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip5Q8R5J9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip5Q8R5J9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip5Q8R5J9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip5Q8R5J9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip5Q8R5J9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip5Q8R5J9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip5Q8R5J9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip5Q8R5J9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip5Q8R5J9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms