Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Top1mtQ8R4U6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Top1mtQ8R4U6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Top1mtQ8R4U6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Top1mtQ8R4U6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Top1mtQ8R4U6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top1mtQ8R4U6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Top1mtQ8R4U6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Top1mtQ8R4U6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Top1mtQ8R4U6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Top1mtQ8R4U6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1mtQ8R4U6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms