Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim29Q8R2Q0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms