Protein–RNA interactions for Protein: Q8K341

Atat1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atat1Q8K341 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atat1Q8K341 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atat1Q8K341 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atat1Q8K341 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atat1Q8K341 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atat1Q8K341 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atat1Q8K341 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atat1Q8K341 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms