Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncapd2Q8K2Z4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms