Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcf3Q8K268 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf3Q8K268 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms