Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Neil3Q8K203 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms