Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vwc2Q8C8N3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vwc2Q8C8N3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vwc2Q8C8N3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vwc2Q8C8N3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vwc2Q8C8N3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vwc2Q8C8N3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vwc2Q8C8N3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vwc2Q8C8N3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vwc2Q8C8N3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vwc2Q8C8N3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vwc2Q8C8N3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vwc2Q8C8N3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms