Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms