Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfrp1Q8C4U3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms