Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0T0

Xkr8, XK-related protein 8, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr8Q8C0T0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Xkr8Q8C0T0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Xkr8Q8C0T0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Xkr8Q8C0T0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Xkr8Q8C0T0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr8Q8C0T0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Xkr8Q8C0T0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Xkr8Q8C0T0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Xkr8Q8C0T0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Xkr8Q8C0T0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Xkr8Q8C0T0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr8Q8C0T0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms