Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg16l1Q8C0J2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms