Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vps13cQ8BX70 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps13cQ8BX70 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms