Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3dQ8BX13 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube3dQ8BX13 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms